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原代細胞染色質位點的開放程度

時間:2018/4/17閱讀:259
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原代細胞轉變過程中每個染色質位點的開放程度,定義出全基因組每個位點由關到開(close to open)和開到關(open to close)的全息動態過程,這些數據證實了一個相對簡單、普遍性的CO/OC邏輯體系。
研究發現,在轉變過程中,早期成纖維細胞的很多特異性開放位點會被迅速關閉(OC),而到重編程后期很多多能性相關的位點則會被打開(CO)。科研團隊認為開關的事件是直接與轉錄因子活性相關,因此對CO/OC位點的基序(motif)進行深入分析。分析發現,CO位點顯著的富集出了重編程因子OCT、SOX、KLF的基序(motif),這與使用的重編程因子Oct4/Sox2/Klf4是吻合的,但CO的過程是非常緩慢的。在更加快速的OC過程中,在OC位點上特異富集出了很強的成纖維細胞特異性的轉錄因子,例如AP-1,ETS,TEAD,RUNX等家族成員,而沒有OCT等重編程因子,證明體細胞相關染色質關閉(OC)過程是OCT、SOX、KLF非依賴的過程。進一步研究發現,與染色質關閉(OC)過程相關的因子都是體細胞重編程的重要障礙。那么,關閉這些位點的OC過程優勢如何在操作呢?通過進一步篩選,研究發現,表觀修飾基因Sap30在體細胞重編程早期被重編程因子激活,并通過促進成纖維細胞關鍵基因啟動子區去乙酰化修飾,而使其啟動子區逐漸關閉,Z終沉默成纖維細胞關鍵調控基因,推動重編程進程。這部分研究結果揭示體原代細胞重編程過程中染色質結構動態變化的規律—CO/OC邏輯,并為理解體細胞重編和其他相關細胞命運轉變提供了新的可參考的理論模型。
Metyrapone    200mg    美替拉酮標準品    54-36-4 
Metyrosine    200mg    甲酪氨酸標準品    672-87-7 
Mexiletine Hydrochloride    200mg    鹽酸美西律標準品    5370/1/4
Mezlocillin Sodium     350mg    美洛西林鈉標準品    42057-22-7 
Mibolerone CIII    200mg    米勃龍標準品    3704/9/4
Miconazole    200mg    咪康唑標準品    22916-47-8 
Midazolam CIV    300mg    咪達唑侖標準品    59467-70-8 
Midodrine Related Compound A    40mg    米多君相關物質A標準品    3600-87-1 
Mifepristone     200mg    美服培酮標準品    84371-65-3 
Milbemycin Oxime     200mg    米爾貝肟標準品    129496-10-2 
原代細胞

 

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