盛元廣通基因測序實驗室管理系統覆蓋完整一代基因測序，旨在提高實驗效率、保證數據質量和信息均符合相關的質量管理標準或規范。通過系統對每個環節的嚴格管理，檢測流程管理實現了訂單生成管理、樣本接收、任務分配、雙盲錄入、樣本領用、結果錄入、質控管理、數據管理等，該解決方案已經應用于多家第三方檢測實驗室、分子/精準醫療檢測中心、特檢實驗室、醫院等機構，并持續迭代更新，以滿足不同客戶的需求。
系統優勢：
■ 信息互通
系統需要能夠接收來自不同測序設備的數據，并將其存儲在統一的數據庫中，確保數據的完整性和可訪問性。確保數據的一致性和標準化對于不同系統間的信息互通至關重要。
■ 質量控制
確保實驗室內的操作流程標準化和規范化，包括樣本處理、實驗操作、數據采集和存儲等環節。建立質量控制標準和指標，監測實驗室內每個階段的數據質量。
■ 溯源數據
記錄數據處理和分析的所有步驟，包括使用的軟件工具、分析算法和參數設置等，以確保可重復性和透明度。記錄數據生成的所有環節，包括測序儀器型號、實驗操作人員、測序參數和時間戳等信息。
■ **穩定
對于數據傳輸和存儲，采用強大的加密技術確保數據**。包括提高數據處理和存儲效率，以確保系統高效穩定地運行。
■ 智能判讀
對基因測序數據進行快速分析和解讀，利用機器學習模型對大量已知數據進行訓練，以識別和預測特定基因變異與**或生理特征之間的關聯。
■ 搭載智能硬件
這些儀器能夠快速、準確地進行大規模的基因測序。其高速、高通量的特性能夠顯著提高實驗室的產出。整合多個實驗室設備和系統的信息，提供統一的控制界面，從而簡化實驗流程。
核心功能：
檢測訂單管理：客戶可以通過系統自主填寫個人信息創建測序管理系統賬號，個人登錄賬號可填寫訂單并上傳。系統可記錄有關訂單客戶的相關信息、樣品的相關信息、實驗要求和特殊要求等信息。訂單下發完成后，客戶可實時查詢訂單的測序進度、測序詳情以及結果報告等信息，支持客戶單個或批量下載訂單結果。在實驗室的整個訂單進行過程中產生任何的異常情況，可以通過郵件或客戶端信息發送的形式通知客戶。
任務分配：實驗室工作人員可以將各種任務（如樣本處理、測序操作、數據分析等）登記到系統中。然后將任務分配給相應的工作人員或實驗組，確保每個任務都有責任人。允許為不同任務設置優先級，確保緊急任務能夠得到更快的處理。根據任務的緊急程度和重要性自動調整任務分配和資源分配。提供實時的任務狀態監控功能，可以查看任務的進展情況，發現并解決可能的延誤或問題。實現任務分配的自動化，根據系統規則和實驗室的工作流程，自動將任務分配給合適的人員或設備。能夠智能地調度實驗室內的資源，包括設備、儀器和人員，以優化任務執行的效率。內建通信工具，方便實驗室內部各個團隊之間的協作與溝通。可以在系統中留言、共享文件。工作人員可以在系統中確認任務的完成，更新任務狀態。
工作流程管理：對客戶提交的樣品進行信息管理，包括樣品的基本信息、送樣時間、樣品圖片、檢測項目、試驗報告時間等。對已收樣檢查無異常后的樣品信息，錄入到檢測業務系統中，并通過相關消息服務等通知試驗人員按時試驗，并把相關試驗結果錄入到系統中，提交下一步校核。試驗結束后，相關檢測過程數據會發送給試驗校核人員進行試驗數據校核。試驗數據及過程數據審核通過后，則進行后續試驗報告打印批準階段，接收到批準后，則可以進行相關試驗報告的打印。試驗報告批準后，把相關試驗報告打印出來，并交付給客戶，報告打印次數及試驗業務結算。
樣本接收：
1. 對每個樣本進行登記，包括樣本的來源、標識、類型等信息，確保樣本的**性和可追溯性。實驗室工作人員根據訂單要求接收樣本，并進行初步的質量控制，如檢查樣本的數量、外觀、保存情況等。
2. 對接收的樣本進行處理，包括提取、建庫、測序等步驟。
3. 對處理后的樣本進行存儲和管理，包括樣本的存儲位置、溫度、濕度等環境條件的控制，以及樣本的出入庫管理。
4. 系統允許實驗室工作人員登記每個收到的樣本，包括樣本來源、采集日期、采集者等信息。為樣本引入**標識符（如條形碼或RFID），以確保樣本在整個流程中的追蹤和識別。
5. 提供實時樣本追蹤功能，讓實驗室管理員隨時了解每個樣本的當前狀態和位置。將樣本分配給相應的實驗組或設備，確保實驗室資源的合理分配。支持根據實驗需求和樣本特性進行自動化的分配流程。
6. 提供樣本存儲信息，包括存儲位置、存儲條件等，以確保樣本的保存質量。允許實驗室人員更新樣本信息，如修改樣本狀態、添加附加信息等。提供權限控制，確保只有*權人員能夠進行樣本信息的修改。
7. 自動發送通知給相關人員，提醒他們有新的樣本到達或需要處理。
雙盲錄入：樣本在錄入系統時，可能需要使用一種匿名或編碼的方式標識，以防止研究人員知曉樣本的身份。系統應提供能夠保障雙盲性的標識方法，如使用無關聯的獨立編碼或隨機生成的樣本標簽。測序數據、實驗結果等數據的錄入過程也應當進行雙盲處理。系統可以在數據錄入階段采用匿名編碼，只有在分析和解讀階段才揭示樣本的真實身份。限制實驗室工作人員對關鍵信息的訪問權限，確保只有特定的研究人員能夠解讀或分析雙盲數據。記錄每次錄入和訪問的信息，以便追蹤數據的處理歷史。提供盲審的功能，允許獨立的審查人員對數據進行審查，確保實驗過程的透明性和質量。當實驗完成后，系統可以生成雙盲報告，以供研究人員分析，同時隱藏相關的身份信息。確保報告中不包含可能泄露樣本身份的信息。
樣本處理：根據實驗需求，準備適量的樣本，并進行必要的預處理確保樣本的質量和可操作性。將提取的DNA/RNA進行建庫處理，即通過添加測序接頭、PCR擴增等步驟，將DNA/RNA轉化為可以進行測序的文庫。對文庫進行質量評估，包括文庫的濃度、特異性等指標的檢測，確保文庫的質量和穩定性。將文庫上機進行測序，一般采用高通量測序技術，對測序數據進行處理和分析，包括序列比對、變異檢測、基因注釋等步驟，*終得到基因序列數據和相關分析結果。
質控管理：根據不同的基因檢測項目，設計相應的質控品，包括質控品的類型、濃度、穩定性等指標的確定。將處理好的質控品進行檢測，包括測序、數據分析等步驟，確保質控品的準確性和穩定性。對質控品進行**管理，包括存儲、使用、報廢等環節的管理，確保質控品的質量和可追溯性。對基因測序實驗的全過程進行質量控制，包括樣本準備、核酸提取、建庫、測序、數據處理和分析等環節的質量控制，確保實驗數據的準確性和可靠性。定期對基因測序實驗室管理系統進行質量評估，包括評估系統的穩定性、準確性、可重復性等指標，確保系統的高質量運行。
數據分析：檢查數據的質量，包括檢查測序質量得分、測序錯誤率、測序深度和覆蓋度等指標，以排除可能存在的測序錯誤和質量問題。對原始數據進行預處理，包括去除低質量讀段、去除接頭序列、去除污染序列等。：根據研究目標，對得到的數據進行進一步的分析，如關聯分析（GWAS）、**分類和預測模型構建等。
檢測報告：（報告批準、報告簽發、報告歸檔等。）將實驗過程中產生的所有數據進行整合，包括樣本信息、測序數據、變異檢測結果等根據不同的基因檢測項目和客戶需求，設計相應的報告模板，包括報告的格式、內容、排版等。根據模板和數據，自動生成檢測報告，包括樣本的基本信息、測序結果、變異檢測結果等。對生成的報告進行審核，檢查報告的準確性、完整性、規范性等，確保報告的質量和可靠性。
