聚合酶鏈PCR反應技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程，其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。聚合酶鏈PCR反應技術的特點集合如下：

1、特異性強

決定 PCR 反應特異性的因素有:①引物與模板 DNA 特異分子的正確結合;②堿基配對原則;③ Taq DNA 聚合酶合成反應的忠實性;④靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結合是關鍵,它取決于所設計引物的特異性及退火溫度。在引物確定的條件下,PCR 退火溫度越高,擴增的特異性越好。Taq DNA 聚合酶的耐高溫性質使反應中引物能在較高的溫度下與模板退火,從而大大增加 PCR 反應的特異性。

2、靈敏度高

從 PCR 的原理可知,PCR 產物的生成是以指數形式增加的,即使按75%的擴增效率計算,單拷貝基因經25次循環后,其基因拷貝數也在一百萬倍以上,即可將極微量(皮克級)DNA 擴增到紫外光下可見的水平(微克級)。

3、簡便快速

現已有多種類型的 PCR 自動擴增儀,只需把反應體系按一定比例混合,置于儀器上,反應便會按所輸入的程序進行,整個 PCR 反應在數小時內就可完成。擴增產物的檢測也比較簡單:可用電泳分析,不用同位素,無放射性污染,易推廣。

4、對標本的純度要求低

不需要分離病毒或細菌及培養細胞,DNA 粗制品及總 RNA 均可作為擴增模板。可直接用各種生物標本(如血液、體腔液、毛發、細胞、活組織等)的 DNA 粗制品擴增檢測。