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DAP-seq應用于褪黑素促進種子萌發的分子機制研究

來源:藍景科信河北生物科技有限公司   2022年11月07日 15:55  

2022年8月,安徽農業大學、中國水稻研究所和上海市農業科學院作物育種栽培研究所在The Plant Journal(IF=5.726)期刊聯合發表了題為“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice”的文章,揭示了OsSGT1和ABI5相互作用,調控OsAPX1的表達,促進褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發的分子機制。其中藍景科信河北生物科技有限公司提供了DAP-seq的技術支持。


隨著人類活動的加劇,重金屬污染日益成為威脅人類健康、生態安全的全球性問題。其中,鉻污染已成為世界范圍內的環境問題。鉻抑制種子萌發、光合作用和礦質的吸收。種子萌發在后續幼苗形態建成中起著關鍵作用,由于其固著的生活方式,更容易受到不利環境的影響。已有研究表明褪黑素(Mel)可以緩解鉻脅迫,促進植物生長發育。但Mel緩解Cr毒性的機制,并不清楚。


該研究發現Mel在水稻種子萌發過程中顯著緩解了Cr脅迫,并且在OsSGT1過表達材料中觀察到萌發性能有顯著改善,而OsSGT1和/或OsABI5的突變顯著消除了Mel介導的對Cr脅迫的緩解作用。互補實驗表明,恢復OsSGT1的表達并不能彌補sgt1-1abi5突變體中Mel介導的Cr脅迫下微弱的萌發表現,但恢復OsSGT1驅動下的OsABI5的表達,sgt1-1abi5突變體中Mel介導的種子萌發和OsAPX1的表達顯著恢復。通過DAP-seq實驗,找到了OsABI5直接調控的OsAPX1基因,其編碼產物促進H2O2清除以維持氧化還原穩態,這對種子萌發至關重要。

圖1. 褪黑素對OsAPX1表達的影響

(a) WT、sgtl、sgtl-labi5和abi5材料在鉻(Cr)脅迫7天后OsAPX1的表達情況。(b) WTempty、OEl、OE2、OE3、sgtl-labi5-ICOMAS、sgtl-labi5-2COMAS、sgtl-labi5-1COMSA和sgtl-labi52COMSA在Cr脅迫7天后OsAPX1的表達情況。 (c) DAP-seq分析OsABI5結合到OsAPX1的peak分布圖。(d) EMSA驗證OsABI5與OsAPX1啟動子有相互作用。 (e) OsAPX1啟動子區域的ChIP-qPCR分析。(f) 酵母單雜交(Y1H)檢測OsABI5與OsAPX1啟動子區域的結合。


本文總結

本研究表明OsSGT1協調OsABI5靶向OsAPX1,介導褪黑素緩解Cr脅迫對種子萌發的影響,這為Mel在生產中的應用提供了指導。


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