制藥工業廢水處理的目的是將廢水中的污染物和有害物質通過一定的方法進行過濾、分離、處理終轉化成無害或可排放的水質，從而起到凈化廢水的作用。不同的污水水質、水量、處理程度等也決定了廢水的處理方法不同，按照其作用原理大致可分為物理處理法、化學處理法、生物處理法三種。

　　物理處理法(1)吸附法該方法是指在不改變污染物理化性質的前提下清除污染物，其原理是污染物附著在吸附劑上，由于重力作用致使其下沉形成沉淀。此法中常用的吸附劑為活性炭、天然礦物材料、高爐濾渣等。

(2)膜過濾法膜過濾法又包括超濾、微濾和精濾等，其原理是根據半透膜的選擇過濾性分離水中的污染物。近年來此法運用廣泛，雖然此法*，大大減少污染物質，但由于半透膜過于微薄致使其容易被腐蝕、被破壞導致濾液里某些成分未被清除，造成了一定危害。

　　(3)萃取法萃取法是指利用廢水與萃取劑間不溶原理對污染物進行分離提取，從而到達去污的作用。當然污染物萃取劑與廢水三者之間有一定的比例。此法適用于高濃度的工業廢水但是其耗水量大且萃取劑資源少，大多數萃取劑都是有機溶劑，萃取完有一定的殘留，存在二次污染的問題。