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蛋白Marker是蛋白分子量標準，是一些已知分子量的蛋白質(zhì)的混合物，像“尺子"一樣用來指示蛋白質(zhì)條帶的大小。Marker的作用主要是用來指示蛋白條帶所對應的分子量大小，只有標準量精確無誤了，實驗結(jié)果才有說服力，因此選擇正確的蛋白Marker也是WB實驗成功的必要條件之一。那么你知道蛋白Marker有哪些分類嗎？
總體來說目比較常用的蛋白Marker分為非預染蛋白Marker和預染蛋白Marker。
非預染蛋白Marker是幾種已知分子量并純化好的蛋白質(zhì)預混液，方便不同大小的蛋白進行比較。非預染的Marker使用上不如預染Marker好用，因為電泳過程中看不到，電泳結(jié)束后經(jīng)過蛋白染色后才能起指示作用，無法在實驗過程中起預示參照作用，屬于“后知后覺"型的。但是由于蛋白沒有附帶染料分子或者是標記分子，所示大小正好是蛋白原本的大小，所以比較準確，可以精確判斷蛋白大小。
預染蛋白Marker是純化好的一些蛋白，通過與染料共價耦聯(lián)后混合在一起，在電泳過程中或者轉(zhuǎn)膜時可以直接觀察到。
預染蛋白Marker的出現(xiàn)方便了我們的實驗，這種蛋白分子量標準可以幫助我們在電泳時、電泳后，以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率——比如，已知垂直電泳最佳分辨區(qū)域大約在膠的2/3處，如果使用預染Marker就可以預測目標蛋白進入最佳分辨區(qū)時停止電泳以得到最佳分辨效果；如果觀察到Marker電泳異常也可以及時終止電泳；還可以在膜上標記蛋白分子量，所以吸引了許多實驗室人員選擇預染蛋白標準。
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