向氧化溝反應池進水并啟動水下推流器。持續進水到氧化溝中水位達到設計有效水深的1/3時，將接種污泥均勻地投入到氧化溝反應池中，采用鼓風曝氣系統開始曝氣，同時連續進水至氧化溝反應池中水位達到設計運行水位(采用轉刷或轉碟曝氣系統,在此時開始曝氣)，在污泥接種完成后的持續進水過程中逐步增加曝氣量至曝氣量達到Z大。

氧化溝水位達到設計運行水位后，持續進水至二沉池中。當二沉池進水2小時后啟動沉淀池刮泥機和污泥回流泵，使在二沉池中沉淀的活性污泥在污泥馴化初期能快速地被收集，并回流到生物處理池中。

污泥回流率應通過觀察回流污泥情況進行調整，一般情況下污泥回流比，應控制在50~之間。

當二沉池達到正常運行水位，應觀察活性污泥狀況，控制進水，直到出現模糊不清的絮狀物，這時可適當進水，換水以補充營養物，換水量可控制在氧化溝池容的25%再重復上述操作。當二沉池開始溢流時，啟動后續污水處理工藝，如消毒工藝。

在生物處理池水位達到正常運行水位后應隨時監控氧化溝中溶解氧(DO)濃度值(通過溶解氧測定儀)，以判斷曝氣量是否足夠，并作出相應調整。在活性污泥馴化過程中，溶解氧的濃度應能滿足以下三方面可能發生的情況下：

a)進水和回流污泥中溶解氧濃度較低;需要較多充氧量；

b)進水缺氧，需要有足夠的溶解氧將其快速改變成充氧環境；

c)當污水中營養物質豐富，需要大量的溶解氧來滿足微生物的生長。

在污泥馴化的過程中，溶解氧的Z低濃度應確保氧化溝出水口處溶解氧濃度不小于1.0mg/L。

在活性污泥馴化的階段中，由于活性污泥的濃度較低，在曝氣的過程中可能會產生大量的泡沫，在實際操作過程中，采取相應的處理措施，如采用噴灑水滴等措施來去除泡沫。