我們都知道，普通的顯微鏡只能通過眼睛進行觀察，而當我們在鏡下找到一個目標位置后再去找另外一個目標時，個目標往往會因為移動樣品之后很難再重新找到，這樣就導致很多數據的丟失，特別是當我們需要對這些數據進行比較的時候，因為沒有原始數據進行對比使我們很苦惱。顯微成像系統的研發成功解決了廣大研究者的苦惱問題，通過顯微成像系統抓取到每次觀察的樣品圖像，這樣就能很好的保存手的原始數據，不僅可以作為實驗的數據進行對比，還能的保存下來作為一份有價值的參考數據。
但是，使用顯微成像系統時，要想取得好的顯微成像效果，那則需要注意以下影響顯微成像質量好壞的九大因素：
1、使用顯微鏡時，被檢物體做的是否標準很重要。如：切片厚度是否太厚，蓋玻片是否符合國標等。
2、顯微鏡物鏡按檔次可分為約6-8個檔，的為平場消色差物鏡。如鏡頭檔次太低，則成像質量會下降。因此，建議選擇平場以上檔次物鏡。
3、聚光鏡孔徑光欄，盡量和物鏡的數值孔徑相符，才能得到的圖像分辨率。
4、調焦系統作為機械部分的重要部件，調焦精度也非常重要。對于生物學初學者或剛接觸顯微鏡的操作者，熟練的使用調焦系統，能快速找到圖像并聚焦，提高工作效率。
5、載物臺在觀察切片時，常做X,Y的移動。如：雙層的機械移動平臺，精度和穩定性較好，能在觀察顯微圖像時提供好的成像質量。
6、非球面集光鏡能提供非常均勻的照明光線，所觀察到的顯微圖像襯度。
7、視場光欄應根據觀察不同的被檢物體和物鏡倍率開啟到合適的位置，如開得過大或過小顯微圖像的視場亮度會受到影響。
