流量計使用中的一些常見故障是由于儀表本身的元件損壞造成的，還有一些是由于選擇不當、安裝不當、環境條件、流體特性等因素造成的，如顯示波動、精度下降甚至儀器損壞。一般可分為兩種：安裝調試失敗和正常運行失敗。
1、在調試期間，預期的故障一般出現在儀表安裝調試階段。一旦被淘汰，以后一般不會在同樣的條件下再次出現。調試中的常見故障一般是由于安裝不當、環境干擾和流體特性造成的。
（1）安裝方面，通常是電磁流量傳感器安裝位置不正確造成的故障，如將傳感器安裝在管道系統的最高點容易積氣；或自上而下安裝在垂直管道上，可能會出現排空現象；或者傳感器后面沒有背壓，流體直接排入大氣，在測量管內形成不滿管。
（2）在環境方面，通常主要是管道雜散電流干擾、空間強電磁波干擾、大電機磁場干擾等。一般對管道雜散電流干擾采取良好的單獨接地保護可以取得滿意的效果。但在雜散電流較大的情況下（如電解車間的管道，有時兩個電極上感應出的交流電勢峰值VPP可高達1V），流量傳感器與管道之間的附加措施和絕緣需要采取。空間電磁波干擾一般通過信號電纜引入，通常采用單層或多層屏蔽保護。
（3）流體方面，被測液體中含有均勻分布的微氣泡，通常不影響電磁流量計的正常工作，但隨著氣泡的增多，儀表的輸出信號會出現波動。如果氣泡大到足以覆蓋整個電極表面，隨著氣泡流過電極，電極電路會瞬間打開，輸出信號會波動更大。
2、流量計運行期故障運行期故障是電磁流量計經過調試并正常運行一段時間后出現的故障。常見的運行期故障一般是由于流量傳感器內壁的粘附層、雷擊和環境條件的變化造成的。
（1）由于電磁流量計常用于測量臟流體，在運行一段時間后，傳感器內壁上的粘附層往往會堆積。這些故障通常是由附著層的導電率過高或過低引起的。若附著物為絕緣層，則電極電路開路，儀器無法正常工作；如果附著層的電導率明顯高于流體的電導率，則會導致電極電路短路，儀器無法正常工作。因此，應及時清除電磁流量計測量管道中附著的結垢層。
（2）雷擊容易在儀表線路中感應出高壓和浪涌電流，對儀表造成損壞。主要通過電源線或勵磁線圈或傳感器與轉換器之間的流量信號線引入，特別是從控制室的電源線引入。
（3）流量計調試過程中環境條件的變化，由于環境條件良好（如無干擾源），流量計工作正常。這時，往往容易忽略安裝條件（例如接地不是很好）。在這種情況下，一旦運行中環境條件發生變化，出現新的干擾源（如流量計附近管道發生電焊，附近安裝大型變壓器），儀表的正常運行。
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