肥料的施用首要包括氮、磷、鉀復合肥、有機肥和微肥。鑒于這些肥料的使用，不同的土壤環境需求制定不同的上肥計劃，這就要求農人放棄基于經驗的傳統上肥方法。選用土壤測驗配方技能，引入土壤養分速測儀等土壤測驗設備，展開土壤測驗工作。
科學研究標明，不同生育期有機蔬菜對土壤氮、磷、鉀及微量元素的施用量不同。假如氮肥施用過少，可能會引起病蟲害。假如施用過少，可能會導致土壤養分供應缺乏。因而，在有機蔬菜的整個成長周期中，檢測土壤中的養分是十分必要的。目前，土壤養分速測儀能夠精確檢測土壤中的氮、磷、鉀、微量元素和pH值等目標，逐步擴展了對農業殘留物的檢測規模。
長期耕耘，對磷的需求量將大大增加，對氮的需求量將削減，此時，有必要增加磷鉀肥的用量，操控氮肥的施用量。假如在瓜果結果后，需求再次上肥，以后每次都需求上肥。在生育期中后期應適當操控鉀肥，以促進無性運動從葉到根的同化，從而形成肉質主根。過多的氮鉀肥缺乏，會使地上成長，根際變小，產值下降。
現階段，越來越多的有機蔬菜生產基地都引進了土壤養分速測儀，它不僅能夠有效改變傳統的農人憑仗經驗進行測土上肥的方法，防止由于上肥不均衡而導致的土壤污染問題，在加強農業生產中的各項工作的相互協作，相同具有重要的積極意義。
